Bakterier som är resistenta mot antibiotika är ett stort problem för vården runt om i världen. Nu finns det fortfarande ofta möjligheter att hitta en behandling som biter, men då måste vi veta vilka antibiotikaresistensgener som bakterien bär.

För att veta det måste vi karaktärisera bakteriens DNA och det kräver dyr utrustning, vilket gör metoden opraktisk eller omöjlig i låginkomstländer. Men nu har forskare från Chalmers utvecklat en metod där det går att göra analysen med förhållandevis enkla mikroskop som redan finns på plats på laboratorier i många låginkomstländer.

I grunden bygger den nya metoden på gensaxtekniken Crispr-Cas9 som används för att identifiera specifika plasmider. Plasmider är cirkulära DNA-molekyler som kan visa om gener i bakterien kan bryta ner antibiotika.

– Om genen vi söker finns på plasmiden klipps den av Cas9 . När DNAt sträcks ut på ett täckglas och avbildas med fluorescensmikroskopi kan den linjära molekylen upptäckas. För att ta bilder för analys kan man använda en vanlig smartphone, som man enkelt fäster i en hållare vid mikroskopet, säger Gaurav Goyal, forskare på Chalmers och en av forskarna bakom studien, i ett pressmeddelande.

Till att börja med ska metoden användas för att förstå spridning av antibiotikaresistens, men i förlängningen hoppas forskarna att den också ska kunna användas för att diagnosticera sjukdom som beror på resistenta bakterier. Metoden kan då även bli ett viktigt verktyg i den rikare delen av världen.

– Vi började utveckla metoden för mindre bemedlade laboratorium, men vilket mikrobiologiskt labb som helst kan utföra den här plasmidanalysen och få stort utbyte av den. Utöver att man kan se att en gen finns på en specifik plasmid kan metoden också bestämma storlek och antal på plasmiderna i provet. Med vår metod är detta mycket enklare än andra metoder, därför tror vi också att den kan komma till nytta även i moderna mikrobiologilabb i höginkomstländer, säger Fredrik Westerlund, professor i kemisk biologi vid Chalmers och en annan av forskarna bakom studien.

Läs hela studien här.

🧬 Nytt test kan förkorta diagnostiseringstid för sjukdomar med årtionde

Ett nytt DNA-test har utvecklats som enskilt kan upptäcka över 50 neurologiska och neuromuskulära sjukdomar. Genom att använda testet går det att förkorta eventuell diagnostisering med upp till årtionden.

Warp NewsAlexander Engelin

🦠 Ny upptäckt om toxiner kan bidra till att lösa antibiotikaresistens

Forskare vid Lunds Universitet har funnit en mekanism som verkar kunna neutralisera toxiner och skydda bakterier från virusattacker. Upptäckten tros vara avgörande för behandling vid antibiotikaresistenta infektioner.

Warp NewsAlexander Engelin